Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVK13-1Q9NX77 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVK13-1Q9NX77 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms