Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SDHAF3Q9NRP4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SDHAF3Q9NRP4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms