Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASCL3Q9NQ33 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ASCL3Q9NQ33 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms