Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRPEL1Q9HAV7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRPEL1Q9HAV7 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms