Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC52A2Q9HAB3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC52A2Q9HAB3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms