Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SENP3Q9H4L4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC008033.3-201ENST00000612531 1407 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SENP3Q9H4L4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms