Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ACTR3CQ9C0K3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms