Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM5Q9C035 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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