Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM3Q9BZL3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM3Q9BZL3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms