Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC11CQ9BY50 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SEC11CQ9BY50 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC11CQ9BY50 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms