Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SNHG12Q9BXW3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SNHG12Q9BXW3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms