Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLVAPQ9BX97 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLVAPQ9BX97 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms