Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBM42Q9BTD8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBM42Q9BTD8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms