Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC5LQ99459 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC5LQ99459 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms