Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ODF3Q96PU9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ODF3Q96PU9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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ODF3Q96PU9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ODF3Q96PU9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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