Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEUROD6Q96NK8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEUROD6Q96NK8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms