Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC7Q96M83 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC7Q96M83 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms