Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDLIM2Q96JY6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDLIM2Q96JY6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms