Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC10A4Q96EP9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC10A4Q96EP9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms