Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ELP4Q96EB1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ELP4Q96EB1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms