Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NXPE2Q96DL1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms