Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4CQ96CF2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4CQ96CF2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms