Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C12orf43Q96C57 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms