Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VTI1AQ96AJ9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms