Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAD50Q92878 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD50Q92878 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms