Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms