Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELBQ8NG08 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELBQ8NG08 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms