Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STAG2Q8N3U4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
STAG2Q8N3U4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms