Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLX4Q8IY92 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLX4Q8IY92 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms