Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLF2Q8IX21 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLF2Q8IX21 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms