Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMCO2Q7Z6W1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms