Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HDXQ7Z353 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms