Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
APTXQ7Z2E3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms