Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FOXD4L3Q6VB84 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms