Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD1Q6UXZ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIGD1Q6UXZ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMIGD1Q6UXZ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms