Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VITQ6UXI7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VITQ6UXI7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms