Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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