Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM88Q6PEY1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms