Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZCCHC12Q6PEW1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms