Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMOD2Q6P5Q4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD2Q6P5Q4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms