Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LEMD1Q68G75 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LEMD1Q68G75 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms