Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TNS3Q68CZ2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNS3Q68CZ2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms