Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AGAP6Q5VW22 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP6Q5VW22 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms