Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PITRM1Q5JRX3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PITRM1Q5JRX3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms