Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJD5

TMEM41B, Transmembrane protein 41B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41BQ5BJD5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM41BQ5BJD5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM41BQ5BJD5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms