Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SFT2D3Q587I9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SFT2D3Q587I9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms