Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC93Q567U6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC93Q567U6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms