Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACTBL2Q562R1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms