Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SBK1Q52WX2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SBK1Q52WX2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms