Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TWISTNBQ3B726 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TWISTNBQ3B726 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms